Der Kleine Wasserfrosch (auch Kleiner Teichfrosch und Tümpelfrosch genannt) bevorzugt vegetationsreiche, eher kleinere und nährstoffarme Gewässer von Gräben und Tümpeln bis zu Waldmoorweihern. Er meidet größere Seen und Flüsse. Wo Kleiner Wasserfrosch und Seefrosch im gleichen Gebiet leben, können sie gemeinsame Nachkommen zeugen. Diese Hybride oder Bastarde werden Teichfrösche genannt. Nach der Fortpflanzungszeit wandern Kleine Wasserfrösche in Landlebensräume, sie sind weniger an Gewässer gebunden als See- und Teichfrösche. Die Grundfarbe der Frösche kann stark zwischen Grün und Braun variieren. Dieses Modell zeigt eine bräunliche Farbvariante.
Seit 1991 gibt es keine sicheren Nachweise des Kleinen Wasserfrosches in Berlin. Die Art ist deshalb auf der Roten Liste Berlin (2017) in Kategorie 0 (ausgestorben) eingestuft. Der Kleine Wasserfrosch ist besonders geschützt gemäß Bundesnaturschutzgesetz.